Kapal selam MSDF bertabrakan dengan kapal selam nuklir AS, menghancurkan 76 orang di dalamnya, termasuk komandannya, Shiro Kaieda. Namun, awak kapal selamat. Kecelakaan itu adalah cerita kedok untuk membawa awak kapal selam MSDF ke Seabat, kapal selam nuklir yang dibangun secara rahasia oleh pemerintah Jepang dan AS. Namun, Kaieda memuat rudal nuklir ke Seabat dan tiba-tiba memberontak dan melarikan diri.